本课题“D-氨基酸脱氢酶辅酶偏好性改造及其分子机制研究”来源于省部级地方投入计划,课题来源单位为广东省科学技术厅。
手性氨基酸,尤其是非天然氨基酸,是合成手性药物、手性农药和手性食品添加剂等精细化学品的关键中间体,D-氨基酸属于非天然氨基酸,不参与蛋白质的合成,但广泛存在于自然界中且对生物体有着重要的意义。由于其在食品、医药等领域展现出来的优势特点,D-氨基酸品种的需求量快速增长,这就需要一种高效绿色的制备方法来满足需求。从反应原子经济学及温和反应条件的角度考虑,利用D-氨基酸脱氢酶催化酮酸不对称还原氨化合成D-氨基酸是最理想的方法之一。内消旋-二氨基庚二酸脱氢酶(meso-DAPDH)是一类NADP+-依赖型氧化还原酶,辅酶NAD(H)和辅酶NADP(H)相比而言,NAD(H)有稳定性好、价格相对较低以及更广的辅酶循环再生方法等优点,实际的生产应用中,多倾向于使用NAD(H)依赖型脱氢酶。因此,本课题构建一种高效筛选能够利用辅酶NADH的高活性氨基酸脱氢酶突变体,并阐释辅酶与氨基酸脱氢酶底物结合中心的构象关系,解析辅酶特异性利用的分子机制。
本研究在D-氨基酸脱氢酶的改造与挖掘方面进行了深入的研究,具体地:1)构建了氨基酸脱氢酶突变体的高通量筛选方法。利用碘硝基四唑紫(INT)/吩嗪硫酸甲酯(PMS)与氨基酸脱氢酶耦联分析,构建了显色耦联筛选体系,基于溶菌酶破壁方法,优化确定了最佳菌体破壁条件;2)利用高通量筛选方法对构建的突变库进行了筛选,筛选获得能够利用NAD+的突变体并对突变体底物结合残基保守性评分;3)利用分子对接和分子动力学模拟对突变体底物中心结合口袋与辅酶NAD+的结合状态,解析辅酶特异性转变的分子机制。同时,深入挖掘传统发酵食品源微生物中的氨基酸脱氢酶,以期获得更多抗性优良的酶基因。本研究从构建方法,突变体筛选及突变体结构分析展开研究,顺利完成了研究计划。基于方法构建、微生物筛选等方面,发表多篇论文,顺利完成课题研究。 |